目标区域测序
产品名称: 目标区域测序
英文名称: Target region sequencing
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基因组目标区域测序
一、产品概述
目标区域测序是指针对感兴趣的目标区域富集后进行大规模测序。随着大量与疾病相关的候选基因、候选区域或候选位点被定位在染色体上。研究者越来越多的关注对基因组中感兴趣的候选区域进行测序分析,不仅大幅缩小了测序区域,而且极大的降低了测序成本,提高了研究效率,非常适合大样本量研究。通过目标区域测序,可以对候选位点或候选基因进行验证,进一步找到候选区域或候选基因内的易感位点。适用于复杂疾病、癌症和单基因病等所有遗传性疾病研究,在个性化诊断、药物靶点筛选等领域具有广阔的应用前景。
二、技术路线
三、技术参数
1、捕获平台
NimbleGen SeqCap EZ Choice Library Kit
Agilent SureSelect Target Enrichment Kit
2、样品要求
样品类型:无降解且无蛋白RNA污染的DNA样品;
样品需求量:≥ 30μg (目标区域大于 17 Mb 并使用 NimbleGen 固相平台);≥6μg (使用 Agilent 液相平台或目标区域小于 17 Mb 并使用 NimbleGen 固相平台);
样品浓度:50-200 ng/μL;
样品纯度:OD260/280 =1.8~2.0。
3、执行周期
按标准流程(不包括高级信息分析),100个样品,平均深度50X的外显子测序项目,执行周期约为40个工作日;按标准流程(不包括高级信息分析),1000个样品(目标区域大小1 Mb),执行周期约为140个工作日(含芯片定制及预实验时间)。